При расчетах самозанятые выдают покупателям чеки, а сведения о расчетах направляют в ИФНС через мобильное приложение «Мой налог». 

Объектом налогообложения НПД признаются доходы от реализации товаров (работ, услуг, имущественных прав). А налоговой базой является денежное выражение дохода, полученного от реализации товаров (работ, услуг, имущественных прав), являющегося объектом налогообложения НПД.

Соответственно, при определении налоговой базы по НПД учитывается вся сумма полученного дохода. Расходы, понесенные самозанятым, учесть нельзя.